Biologie-Moleculaire | Dr. Goulu

Comment les données biologiques sont-elles analysées à grande échelle ?

Sat, 23 May 2026 00:00:00 +0000

Réponse publiée

Je connais un prof de bioinformatique qui a passé sa thèse de doctorat à analyser un tout petit bout d’ADN humain dans le cadre du . Il avait fallu presque 15 ans de travail à des milliers de chercheurs comme lui pour obtenir le génome d’un seul humain.

Quand il me racontait ça il y a quelques années, il me disait pouvoir obtenir un génome humain complet en une semaine, sur une seule table de son labo.

Aujourd’hui j’ai demandé à Gemini IA

. Un record du monde homologué par le Guinness World Records en moins de 4 heures (précisément 3 heures et 57 minutes).

Cette prouesse a été réalisée par les équipes de Broad Clinical Labs, de Roche et du Boston Children’s Hospital grâce à la technologie Sequencing by Expansion(SBX). [ , , , ]

Donc voilà, si vous avez 1000 échantillons d’ADN et une équipe de 10 chercheurs, voire juste des étudiants qui savent utiliser les machines , vous pouvez analyser tous les échantillons, les comparer, et écrire un article scientifique là dessus en une année.

Et de telles équipes, il y en a des milliers sur Terre actuellement.

Le prof que je connais est un grand partisan, voire même un initiateur de en sciences de la vie. Ca signifie que beaucoup, voire la quasi-totalité des génomes décodés sont disponibles librement.

Ca signifie que désormais des millions de génomes de milliers d’espèces dont des humains (anonymisés) sont disponibles gratuitement pour la recherche

Petite question à Gemini IA :

La plus grande base de données de génomes humains complets en accès libre (Open Data / Open Access) est celle du projet américain All of Us (opéré par les NIH), qui propose plus de 414 000 génomes complets.

Voilà . Si vous voulez vous lancer en bioinformatique, il ne vous faut même plus de séquenceur ADN. Un gros ordinateur, mais surtout une très bonne connexion internet pour downloader des Petaoctets suffit

Est-il vrai qu’une séquence ADN SV40 (provenant du singe) et 2 autres séquences inconnues ont été constatés dans certains lots du vaccin ARN de Pfizer ? Est-il vrai qu’ils peuvent s’ajouter à notre ADN ?

Fri, 08 Mar 2024 00:00:00 +0000

Réponse publiée

Non et non.

Vous le dites vous même : le est un virus à ADN alors que les vaccins à ARNm contiennent de l’ARNm, avec un petit m pour .

ADN et ARN(m) sont incompatibles. Traduire l’un en l’autre nécessite de l’ ou de la que même les complotistes n’ont pas réussi à imaginer dans leurs délires antivax.
L’ARNm ne peut donc pas s’intégrer à notre ADN. Il n’entre même pas dans le noyau cellulaire, il ne fait que ce pour quoi le virus contient la même séquence : faire produire la protéine S du virus à la cellule.

Pourquoi la structure de l'ADN serait-elle aussi efficace en tant que support de données ?

Tue, 20 Jul 2021 00:00:00 +0000

Réponse publiée

L’ADN est un support de données. Le code génétique des êtres vivants y est codé par 4 bases (ACTG) donc en base 4, 3 bases successives formant un codant un acide aminé, et une séquence de codons codant une protéine.

Maintenant qu’on dispose de moyens de lire et écrire l’ADN, mais surtout de la copier très vite, on peut l’utiliser pour , une base portant 2bits, 4 bases successives un octet..

On peut ainsi stocker potentiellement 215 Petabytes dans un gramme d’ADN, et le stocker pendant 50'000 ans environ.

A part quelques applications de démonstration comme le stockage de la Wikipédia complete en 2019, les applications actuelles sont plutôt dans le traçage et l’authentification de produits. Les grands de ce monde peuvent par exemple signer avec une encre marquée par des séquences ADN individualisées.

Par quels phénomènes deux gamètes de génomes différents se mélangent ses molécules et atomes aux fréquences ondulatoires quantiques différentes créent la vie ?

Thu, 24 Jun 2021 00:00:00 +0000

Réponse publiée

La reproduction sexuée n’est pas nécessaire à la vie. Il y a plein de formes de vie qui se reproduisent sans sexe, notamment toutes les bactéries qui se reproduisent par division cellulaire.

La caractéristique principale d’un organisme vivant est de pouvoir créer des copies de lui-même en puisant la matière et l’énergie nécessaire dans son environnement. Dans toutes les formes de vie que nous connaissons, c’est purement chimique, il n y a rien d’atomique, de quantique ou d’ondulatoire là dedans.

L’hypothèse la plus vraisemblable actuellement concernant l’apparition de la vie est l'

Qui aurait impliqué des molécules capables de s’autorepliquer, les

On sait en fabriquer en laboratoire qui se répliquent à toute vitesse (exponentiellement, doublement toutes les 5 minutes environ sans mon souvenir) et qui évoluent immédiatement

La reproduction sexuée est apparue beaucoup, beaucoup plus tard, voyez

Herman, D., & Collenot, A. (1993). L’origine et l’évolution de la reproduction sexuée. Médecine/Sciences, 9(12), 1392–1403. (

à ce sujet.

Un virus du genre corona est-il si complexe pour un chercheur que la molécule qui le supprimerait ne soit pas trouvée ?

Mon, 23 Mar 2020 00:00:00 +0000

Réponse publiée

Il y a plein de molécules qui supprimeraient le , le coronavirus et même le virus du SIDA, mais elles ont un effet secondaire indésirable : elles vous suppriment vous aussi.

Pour mettre au point un médicament ou un vaccin, il y a trois possibilités:

coup de bol, un médicament ou vaccin efficace pour autre chose est aussi efficace pour une nouvelle maladie. Dans ce cas on peut avoir très rapidement une solution, pas idéale, mais acceptable en attendant mieux. Ca a été le cas de contre le SIDA C’est peut-être le cas pour la dans le cas du Covid-19
il faut faire des recherches approfondies sur l’agent pathogène, identifier ses faiblesses, les attaquer sans risques pour l’être humain, faire des essais in vitro, puis in vivo sur des souris, publier des articles et/ou déposer des brevets, faire autoriser la substance par des organismes officiels de plusieurs pays, la tester en “double aveugle” sur des humains, mesurer son efficacité réelle, publier les résultats, faire accepter le remboursement du médicament, le produire et le distribuer en grandes quantités. Compter dix ans, comme pour les par exemple.
Sauter toutes ces étapes en trouvant un volontaire qui n’a rien à perdre. Vous ?