Quelle est la structure chimique de COVID-19 ?

Réponse publiée sur Quora

Covid-19 est une maladie, elle n’a pas de structure chimique. Le D de CoviD signifie Disease = maladie.

Le virus responsable est le SARS-CoV-2 dont la structure protéitique est la suivante: (copié/collé de la Wikipédia) :

Comme d’autres coronavirus , le SARS-CoV-2 possède quatre protéines structurales :

1. protéines S (dites protéine spike ou protéine de pointe) : Elles forment les protubérances de la « couronne », présumée essentielles pour lier le virus à un (ou plusieurs) récepteurs(s) en surface d’une cellule (après activation par une autre protéines de la membrane cellulaire). Ces protéines semblent être l’un des principaux déterminants du tropisme viral (« le tropisme d’un virus se définit comme l’ensemble des cellules cibles et permissives à ce virus. Le connaître permet de déterminer le ou les organes cibles, ainsi que la ou les espèces animales pouvant être infectées » ; Les virus à ARN mutent facilement ; quand une mutation permet au virus de changer son tropisme, il peut, soit franchir la barrière des espèces et infecter un nouvel hôte (humain, porc par exemple), soit cibler un autre organe (péritonite infectieuse fatale du chat et du furet par exemple, avec un autre coronavirus). La publication du génome viral a permis de la modéliser (voir ci-contre). Elle a aussi été décrite au niveau atomique par la microscopie électronique cryogénique . Elle semble plus efficace que celle du SARS-CoV (affinité plus élevée pour l’ACE2 humain, un homologue de l’ACE), ce qui expliquerait pourquoi la Covid-19 se répand beaucoup plus vite que le SRAS Un segment de cette protéine spike semble caractéristique du SARS-CoV-2.
2. protéine E (enveloppe) ;
3. protéine M (membrane) ;
4. protéine N (nucléocapside ) ; c’est elle qui enveloppe et protège l’ARN viral (le code génétique du virus).

Les protéines S, E et M constituent, ensemble, l’enveloppe virale.

Outre un segment de la protéine S (Spike), un court gène supplémentaire semble également spécifique à ce virus (segment dont la réalité biologique et le rôle éventuel étaient fin janvier encore à démontrer*).*

on y trouve ce dessin de la

Glycoprotéine de pointe du SARS-CoV-2. PDB: 6VSB. La protéine entière est un homotrimère , dont seul monomère est ici mis en évidence, le reste du trimère étant représenté en gris. Certaines parties de la structure réelle ne sont pas représentées. Sont représentés les domaines protéiques N-terminal (lettre N) à C-terminal (C) :

Domaine N-terminal (bleu) ; domaine de liaison au récepteur ACE2 (magenta) ; structure générale (cyan), hélice centrale (orange) ; le domaine du connecteur qui ancre la protéine de pointe à l’enveloppe lipidique du virus (violet). Les liaisons disulfure sont en Jaune, et les glucides en Rouge. Le gris présente la membrane lipidique du virus.

Voilà, avec ça vous devriez être capable de nous faire un vaccin …